O Programa de Qualificação e de Desenvolvimento do Ecomuseu Municipal do Seixal foi aprovado pela CMS em Março de 2001 e, embora careça de revisão e actualização, ainda estrutura boa parte das linhas gerais da sua programação museológica.

No essencial, perspectiva a qualificação dos actuais núcleos e extensões museológicas, numa planificação onde se destacam a musealização da Mundet, onde entretanto foram instalados os serviços centrais do Ecomuseu, da Olaria Romana da Quinta do Rouxinol, do Moinho de Maré de Corroios, do Núcleo Naval de Arrentela e do “circuito da pólvora negra” da antiga Fábrica de Pólvora de Vale de Milhaços.